El Río Uruguay alberga mas de 250 especies de aves en los distintos ecosistemas que lo integran:

En el río propiamente dicho encontramos especies únicas de carácter migratorio como los Rayadores, Aguila pescadora, Halcón peregrino, Gaviotines, etc. La selva en galería alberga a las familias de los fruteros, pavas del monte, urracas y tingazúes.

En los humedales podemos observar un sinnúmero de patos, garzas, biguaes y chorlos. 

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